MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 plasmid p1ABTCDC0715

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017165	AT	4	8	18	25	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017165	TAAA	2	8	38	45	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017165	A	6	6	43	48	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017165	TAA	2	6	49	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017165	AATT	2	8	84	91	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017165	T	7	7	126	132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017165	T	6	6	154	159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017165	A	7	7	184	190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017165	GTT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017165	A	6	6	225	230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017165	A	7	7	254	260	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
12	NC_017165	A	6	6	293	298	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
13	NC_017165	GTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239403
14	NC_017165	TG	3	6	354	359	0 %	50 %	50 %	0 %	385239403
15	NC_017165	A	7	7	362	368	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
16	NC_017165	TTGGA	2	10	388	397	20 %	40 %	40 %	0 %	385239403
17	NC_017165	A	6	6	442	447	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
18	NC_017165	TATT	2	8	449	456	25 %	75 %	0 %	0 %	385239403
19	NC_017165	A	6	6	476	481	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
20	NC_017165	T	6	6	486	491	0 %	100 %	0 %	0 %	385239403
21	NC_017165	A	6	6	625	630	100 %	0 %	0 %	0 %	385239404
22	NC_017165	TAGA	2	8	667	674	50 %	25 %	25 %	0 %	385239404
23	NC_017165	T	7	7	737	743	0 %	100 %	0 %	0 %	385239404
24	NC_017165	A	6	6	811	816	100 %	0 %	0 %	0 %	385239404
25	NC_017165	AGCGA	2	10	825	834	40 %	0 %	40 %	20 %	385239404
26	NC_017165	T	8	8	853	860	0 %	100 %	0 %	0 %	385239404
27	NC_017165	A	6	6	882	887	100 %	0 %	0 %	0 %	385239404
28	NC_017165	AGCGAA	2	12	904	915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385239404
29	NC_017165	AGCGA	2	10	931	940	40 %	0 %	40 %	20 %	385239404
30	NC_017165	ATT	2	6	976	981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017165	ATA	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017165	A	6	6	1171	1176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017165	GA	3	6	1187	1192	50 %	0 %	50 %	0 %	385239405
34	NC_017165	ACTTAG	2	12	1234	1245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385239405
35	NC_017165	AAC	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239405
36	NC_017165	TTG	2	6	1273	1278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239405
37	NC_017165	ATCA	2	8	1344	1351	50 %	25 %	0 %	25 %	385239405
38	NC_017165	CG	3	6	1412	1417	0 %	0 %	50 %	50 %	385239405
39	NC_017165	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	385239405
40	NC_017165	CTG	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239405
41	NC_017165	GAA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239405
42	NC_017165	TAG	2	6	1598	1603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239405
43	NC_017165	TAG	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239405
44	NC_017165	AGAA	2	8	1695	1702	75 %	0 %	25 %	0 %	385239405
45	NC_017165	AAAT	2	8	1777	1784	75 %	25 %	0 %	0 %	385239405
46	NC_017165	AGA	3	9	1864	1872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239405
47	NC_017165	T	6	6	1915	1920	0 %	100 %	0 %	0 %	385239405
48	NC_017165	A	7	7	2084	2090	100 %	0 %	0 %	0 %	385239405
49	NC_017165	A	6	6	2158	2163	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
50	NC_017165	A	6	6	2288	2293	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
51	NC_017165	ATC	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239406
52	NC_017165	AAG	2	6	2309	2314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239406
53	NC_017165	TGA	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239406
54	NC_017165	A	7	7	2328	2334	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
55	NC_017165	A	6	6	2362	2367	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
56	NC_017165	GAA	2	6	2380	2385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239406
57	NC_017165	CAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239406
58	NC_017165	CAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239406
59	NC_017165	CAC	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239406
60	NC_017165	ACA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239406
61	NC_017165	CAA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239406
62	NC_017165	AAT	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239406
63	NC_017165	CACAA	2	10	2642	2651	60 %	0 %	0 %	40 %	385239406
64	NC_017165	A	6	6	2650	2655	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
65	NC_017165	ATT	2	6	2753	2758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017165	GCT	2	6	2767	2772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017165	GAA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017165	AAAAAG	2	12	2841	2852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017165	ATT	2	6	2866	2871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017165	TGA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017165	AAT	2	6	2907	2912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017165	A	7	7	2935	2941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017165	TAT	2	6	3026	3031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017165	CCA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239407
75	NC_017165	TTA	2	6	3155	3160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239407
76	NC_017165	TATTAA	2	12	3198	3209	50 %	50 %	0 %	0 %	385239407
77	NC_017165	TA	3	6	3234	3239	50 %	50 %	0 %	0 %	385239407
78	NC_017165	TCA	2	6	3338	3343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239407
79	NC_017165	TGC	2	6	3394	3399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239407
80	NC_017165	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239407
81	NC_017165	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239407
82	NC_017165	A	6	6	3546	3551	100 %	0 %	0 %	0 %	385239407
83	NC_017165	TAAAC	2	10	3633	3642	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017165	ACT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017165	TAA	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017165	T	6	6	3828	3833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017165	CTT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017165	AAT	2	6	3859	3864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017165	ATT	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017165	TA	3	6	3922	3927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017165	T	6	6	3940	3945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017165	AGAC	2	8	4062	4069	50 %	0 %	25 %	25 %	385239408
93	NC_017165	GAA	2	6	4081	4086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239408
94	NC_017165	TGG	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239408
95	NC_017165	TGA	2	6	4149	4154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239408
96	NC_017165	ATC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239408
97	NC_017165	GCAAG	2	10	4186	4195	40 %	0 %	40 %	20 %	385239408
98	NC_017165	CA	3	6	4239	4244	50 %	0 %	0 %	50 %	385239409
99	NC_017165	GCTT	2	8	4293	4300	0 %	50 %	25 %	25 %	385239409
100	NC_017165	TGA	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239409
101	NC_017165	CAA	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239409
102	NC_017165	CTTG	2	8	4439	4446	0 %	50 %	25 %	25 %	385239409
103	NC_017165	ATGA	2	8	4481	4488	50 %	25 %	25 %	0 %	385239409
104	NC_017165	ATGCT	2	10	4500	4509	20 %	40 %	20 %	20 %	385239409
105	NC_017165	A	6	6	4519	4524	100 %	0 %	0 %	0 %	385239409
106	NC_017165	TCA	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239409
107	NC_017165	G	6	6	4574	4579	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017165	TAG	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017165	TTATA	2	10	4627	4636	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017165	GTT	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017165	TAAA	2	8	4666	4673	75 %	25 %	0 %	0 %	385239410
112	NC_017165	TAC	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
113	NC_017165	TGA	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
114	NC_017165	ATTC	2	8	4899	4906	25 %	50 %	0 %	25 %	385239410
115	NC_017165	TAT	2	6	4937	4942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239410
116	NC_017165	AGGA	2	8	4951	4958	50 %	0 %	50 %	0 %	385239410
117	NC_017165	AAT	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
118	NC_017165	GTG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239410
119	NC_017165	TAC	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
120	NC_017165	CAG	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239410
121	NC_017165	CTC	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239410
122	NC_017165	AGA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239410
123	NC_017165	ATA	2	6	5440	5445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
124	NC_017165	ATG	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
125	NC_017165	A	6	6	5564	5569	100 %	0 %	0 %	0 %	385239410
126	NC_017165	TAT	2	6	5580	5585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239410
127	NC_017165	GATG	2	8	5594	5601	25 %	25 %	50 %	0 %	385239410
128	NC_017165	ATTA	2	8	5610	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	385239410
129	NC_017165	TCA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
130	NC_017165	TC	3	6	5671	5676	0 %	50 %	0 %	50 %	385239410
131	NC_017165	ATG	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
132	NC_017165	TA	3	6	5778	5783	50 %	50 %	0 %	0 %	385239410
133	NC_017165	ATT	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239410
134	NC_017165	T	6	6	5826	5831	0 %	100 %	0 %	0 %	385239410
135	NC_017165	ATA	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
136	NC_017165	AAG	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239410
137	NC_017165	ACC	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239410
138	NC_017165	CAG	2	6	5982	5987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239410
139	NC_017165	ACTTT	2	10	6052	6061	20 %	60 %	0 %	20 %	385239410
140	NC_017165	A	6	6	6115	6120	100 %	0 %	0 %	0 %	385239410
141	NC_017165	TAA	2	6	6146	6151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
142	NC_017165	A	7	7	6172	6178	100 %	0 %	0 %	0 %	385239410
143	NC_017165	TAA	2	6	6179	6184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
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166	NC_017165	T	7	7	7307	7313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017165	TCA	2	6	8187	8192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_017165	TTA	2	6	8719	8724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.